Если отмечена опция Открывать незакрытые вкладки файлов прошлого сеанса в Настройки→Разное, то Notepad++ автоматически сохраняет текущую сессию при выходе (в session.xml), но при условии, что он не был запущен с параметром командной строки -nosession.
В сессию сохраняются следующие параметры: